Norrbotten kan nu sekvensera covidprover själv

Region Norrbotten har fått möjlighet att sekvensera covidviruset på eget labb genom ett EU-finansierat projekt. Projektet INFRAGEN, som samordnas av Folkhälsomyndigheten, har försett regionen med ny utrustning som bland annat inkluderar den lilla sekvenseringsmaskinen Minion.

Biomedicinarna Johanna Keskitalo och Fiona Murray, som är projektledare, förklarar att målet är att sekvensera tio procent av alla positiva prover. Tidigare skickades proverna till Karolinska Institutet i Stockholm, vilket tog tid och krävde kyltransport. I Norrbotten har som mest några hundra prover i veckan skickats, medan det på senare tid varit cirka 50-75 prover.

Metoden som används kallas Next Generation Sequencing och gör det möjligt att snabbt upptäcka nya mutationer genom att sekvensera virusets arvsmassa. Utöver covid kan utrustningen även användas för andra kända och okända virus och bakterier med andra typer av reagenser.

– Vi står helt klart bättre rustade för nästa pandemi med den nya utrustningen, säger Johanna Keskitalo. Än så länge är det bara de två biomedicinarna som kan hantera sekvenseringen, men de planerar att utbilda fler personal eftersom processen beskrivs som ganska pillrig.